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空間產品

通過(guo)采用(yong)尖端的空(kong)間(jian)技術，能夠在保持細胞原始空(kong)間(jian)位置(zhi)的同(tong)時，精(jing)確(que)分析和可視化基因表達和蛋白標記等，深(shen)入(ru)研(yan)究組(zu)織微環境中(zhong)的細胞互作。

10x Genomics空間轉錄組（含Visium HD）

將基因空間表(biao)達可視(shi)化，在識別不同(tong)細胞群的同(tong)時(shi)保留空間背(bei)景(jing)，提供(gong)了關于組織(zhi)微(wei)環境中細胞功能、表(biao)型和位置關系的關鍵信(xin)息。

Stereo-seq空間轉錄組

該技術(shu)通(tong)過(guo)時空(kong)芯片捕獲組(zu)織中的(de) mRNA，并通(tong)過(guo)空(kong)間(jian)條形碼（Coordinate ID，CID）還原(yuan)回(hui)空(kong)間(jian)位(wei)(wei)置實現(xian)組(zu)織原(yuan)位(wei)(wei)測序，為深入地了解(jie)細(xi)胞的(de)基因表達及形態與(yu)局部環(huan)境之間(jian)的(de)關系建立強大的(de)研究基礎。

Akoya空間蛋白組

可提供同(tong)時(shi)檢測幾(ji)種（PhenoImager Fusion）到100多種（PhenoCycler-Fusion）生物蛋白標志物的解(jie)決方案，準確定位細胞(bao)空(kong)間分(fen)布、判斷(duan)細胞(bao)行為、識別不同(tong)的細胞(bao)聚集(ji)模式，實現組織(zhi)原位超(chao)多靶點(dian)蛋白標記(ji)分(fen)析。

應用方向
  • 腫瘤及免疫研究：有助于識別腫瘤微環境中的細胞相互作用，以及免疫細胞在腫瘤進展和治療反應中的角色；
  • 病理學研究：通過在組織切片上進行高分辨率的分子表達分析，有助于揭示疾病的分子機制和組織中的病理變化；
  • 發育生物學：通過分析發育過程中細胞在空間上的分布和基因表達變化，揭示細胞分化和組織形態形成的動態過程；
  • 空間圖譜：構建器官和組織的空間圖譜，展示細胞在特定生理和病理狀態下的空間分布和相互作用，這對于理解復雜生物系統的結構和功能至關重要；
  • 生物標志物挖掘：通過分析細胞在特定組織環境中的表達模式，可以識別與疾病進程、治療響應或預后相關的關鍵分子標志物；
產品優勢
高分辨率實現亞細胞級分子定位

Stereo-seq、Visium HD和(he)Akoya空(kong)間蛋(dan)白組均能達到亞細(xi)胞級的(de)分辨率，實(shi)現對單個細(xi)胞及(ji)分子信(xin)息進行空(kong)間定位和(he)檢測

揭示不同區域中細胞的組成及功能狀態

可視化腫瘤細(xi)(xi)胞、免(mian)疫細(xi)(xi)胞等多種細(xi)(xi)胞的(de)(de)(de)亞型，詳(xiang)細(xi)(xi)識(shi)別(bie)不同(tong)(tong)區(qu)域(yu)(yu)中的(de)(de)(de)免(mian)疫細(xi)(xi)胞的(de)(de)(de)分布及(ji)組成，可實現同(tong)(tong)時展(zhan)示樣本間以(yi)及(ji)不同(tong)(tong)區(qu)域(yu)(yu)的(de)(de)(de)差異(yi)和功(gong)能狀態(tai)

更深層次理解組織微環境，發現罕見細胞和生物標志物

根(gen)據對腫(zhong)瘤(liu)切(qie)片樣本中(zhong)單細胞分辨(bian)率下目標(biao)分子(zi)標(biao)志物(wu)的(de)表(biao)達定(ding)位，精確鑒定(ding)目標(biao)細胞類型的(de)分布，繪制腫(zhong)瘤(liu)免(mian)疫微環境景觀圖譜，可發現以往容易忽略的(de)罕見細胞、微小結構

案例解析

頭(tou)頸部(bu)鱗狀細胞癌(HNSCC)腫瘤微環(huan)境(jing)空(kong)間激活途徑(jing)

單細胞聯合空間轉錄組揭示頭頸鱗狀細胞癌腫瘤微環境中增殖型耗竭CD8+T細胞作用

 

該研究利(li)用單(dan)細(xi)胞(bao)(bao)水平的多組學(xue)技(ji)術構建了(le)(le)人頭頸(jing)(jing)鱗狀(zhuang)細(xi)胞(bao)(bao)癌(ai)的多維度腫(zhong)瘤(liu)微(wei)環(huan)境圖譜，從中鑒定出了(le)(le)一群具有(you)增(zeng)殖潛能并(bing)能持(chi)續(xu)發(fa)(fa)揮抗(kang)瘤(liu)效(xiao)應(ying)的新增(zeng)殖型耗(hao)竭CD8+T細(xi)胞(bao)(bao)，并(bing)深入解析(xi)了(le)(le)其(qi)在腫(zhong)瘤(liu)微(wei)環(huan)境中的作(zuo)用機制。本研究系統性地解析(xi)了(le)(le)頭頸(jing)(jing)鱗狀(zhuang)細(xi)胞(bao)(bao)癌(ai)微(wei)環(huan)境中增(zeng)殖型耗(hao)蝎CDB+T細(xi)胞(bao)(bao)的多維度特征，證實了(le)(le)其(qi)豐度與HPV陽性頭頸(jing)(jing)鮮狀(zhuang)細(xi)胞(bao)(bao)癌(ai)患者預后間的關聯性，以耗(hao)竭CD8+T細(xi)胞(bao)(bao)異質性為切(qie)入點(dian)，為HPV感染狀(zhuang)態如(ru)何(he)影響CDK4抑制劑(ji)對頭頸(jing)(jing)鮮狀(zhuang)細(xi)胞(bao)(bao)癌(ai)的療(liao)效(xiao)提(ti)供了(le)(le)新的解釋(shi)，有(you)助(zhu)于推動(dong)頭頸(jing)(jing)鮮狀(zhuang)細(xi)胞(bao)(bao)癌(ai)精準(zhun)治(zhi)療(liao)的進一步發(fa)(fa)展。

參考文獻：Cheng D, Qiu K,Rao Y. et al. Proliferative exhausted CD8+ T cells exacerbate long-lasting anti-tumor effects in human papillomavirus-positive head and neck squamous cell carcinoma [J]. Elife. 2023 Feb 22:12:e82705.